«Истинная природа евангельской церкви» — это глубокое библейско-богословское исследование, в котором Джон Оуэн последовательно раскрывает сущность, основание и устройство новозаветной церкви. Опираясь на Священное Писание и опыт первоапостольской эпохи, автор доказывает, что подлинная церковь Христова в своём видимом выражении существует не как всеобщая или национальная структура, а как локальное сообщество верующих, сознательно и добровольно соединённых в завете для совместного послушания Христу и исполнения Его заповедей.
Оуэн отвергает представление о централизованной видимой церкви иерархией власти, критикуя как папское господство, так и любые формы церковного правления, заимствующие принципы светской власти. Он настаивает на том, что всякая церковная власть по своей природе духовна, служебна и направлена исключительно на назидание, а не на принуждение или господство над совестью верующих. Власть в церкви принадлежит Христу как её единственной Главе и осуществляется через Его Слово в рамках установленного Им порядка.
Особое внимание в труде уделяется вопросу членства в церкви: Оуэн подчёркивает, что церковь должна состоять из людей, исповедующих веру и стремящихся к святой жизни, а не из формальных участников, связанных лишь обрядом, традицией или гражданской принадлежностью. Неотъемлемым признаком истинной евангельской церкви он считает церковную дисциплину, без которой невозможно сохранить чистоту учения, духовный порядок и подлинное братское общение.
Этот труд представляет собой зрелое и взвешенное выражение конгрегационалистской экклезиологии, отличающееся глубиной аргументации, пастырской трезвостью и практической направленностью. Книга остаётся актуальной и сегодня, поскольку затрагивает фундаментальные вопросы природы церкви, границ её власти, ответственности верующих и соотношения духовной жизни с внешними формами церковного устройства.